BIOS4000 – Design og analyse av biologiske studier

Kort om emnet

Emnet gir en grundig innføring i viktige aspekter rundt design av biologiske studier og statistisk analyse i biologi. Det legges vekt på bruk av statistiske modeller for å kunne trekke slutninger om biologiske mønstre og prosesser. Gjennom prosjektarbeid, regneøvelser og dataøvelser får du grunnleggende ferdigheter i moderne biologisk forskning. Det statistiske programmeringsmiljøet R benyttes gjennom hele kurset.

Hva lærer du?

Etter å ha fullført emnet forventes du ha følgende kompetanse:

• Forstå forskjellen mellom observasjonsstudier og eksperimenter, og kunne vurdere resultater fra ulike typer studier i en biologisk sammenheng.
• Forstå betydningen av begrepene pseudoreplikasjon, sammenblanding (konfundering), eksperimentell kontroll, randomisering, sampling skjevhet, stratifisert sampling og blokking i sammenheng med planlegging og analyse av biologiske studier.
• Kunne utføre Monte Carlo-simuleringer for å vurdere ulike studiedesigner og statistiske modeller.
• Kunne tilpasse biologisk relevante modeller basert på normalfordeling, binomisk fordeling og Poisson-fordeling (GLM), og kunne beregne lineære kontraster og prediksjoner med konfidensintervaller fra disse tilpasningene, samt å kunne vurdere hvor godt disse modellene passer til data.
• Kunne tilpasse hierarkiske modeller med normalfordelte responsvariabler og tolke disse.
• Kunne vurdere kilder til forventningsskjevhet i modeller som tilpasses biologiske data, herunder effekter av sampling skjevhet, målefeil i forklaringsvariabler (attenuasjon) og frafall av studieenheter gjennom studiets forløp.
• Ha kjennskap til vanlige tankefeil i tolkning av statistiske analyser.
• Ha kjennskap til prinsipper for valg av modell som er best egnet for å besvare spesifikke forskningsspørsmål.
• Kunne forstå og sette seg inn litteratur som bygger på kursets innhold og kunne presentere dette muntlig på en pedagogisk måte for medstudenter.

Obligatoriske forkunnskaper

STK1000 – Innføring i anvendt statistikk eller tilsvarende.

Anbefalte forkunnskaper

Elementære forkunnskaper i  programmering tilsvarende innholdet i BIOS1100 – Innføring i beregningsmodeller for biovitenskap er sterkt anbefalt. 

Andre anbefalte forkunnskaper er  BIOS1110 – Celle- og molekylærbiologi, BIOS1120 – Fysiologi, BIOS1140 – Evolusjon og genetikk og BIOS2100 – Generell økologi.

Overlappende emner

• 10 studiepoeng overlapp med BIOS3000 – Design og analyse av biologiske studier.
• 10 studiepoeng overlapp med BIO2150 – Biostatistikk og studiedesign (nedlagt).
• 10 studiepoeng overlapp med BIO2130 – Biostatistikk (nedlagt).
• 10 studiepoeng overlapp med BIO2110 – Eksperimentell økologi (nedlagt).

Undervisning

Emnet består av:

• Forelesninger

• Oppgave-løsning med veiledning

• Obligatoriske innleveringer

• Et obligatorisk litteraturstudium med muntlig forelesning for medstudenter (individuelt eller i grupper av 2)

Alt kursmateriell er på engelsk og alle rapporter må skrives på engelsk.

Alle obligatoriske aktiviteter må være godkjente for å kunne gå opp til eksamen. Det er obligatorisk oppmøte til første forelesning for studenter som skal følge undervisning i emnet. Dette gjelder også for studenter på venteliste. Du mister plassen på emnet dersom forfall til første forelesning ikke er meldt til studieinfo@ibv.uio.no , før forelesningen starter.

Godkjente obligatoriske aktiviteter er gyldige i 3 år.

Adgang til undervisning: Dersom du har gjennomført og fått godkjent obligatorisk undervisning, har du ikke krav på ny undervisning. Dersom du har fått undervisningsopptak til emnet, men ikke har gjennomført eller fått godkjent obligatorisk undervisning, har du rett til ny undervisning når det er ledig kapasitet.

Eksamen

Avsluttende skriftlig eksamen som teller 100% av karakteren.

Alle obligatoriske aktiviteter må være godkjente for å kunne gå opp til eksamen. 

Som eksamensforsøk i dette emnet teller også forsøk i følgende tilsvarende emner: BIOS3000 – Design og analyse av biologiske studier, BIO2150 – Biostatistikk og studiedesign (nedlagt), BIO2130 – Biostatistikk (nedlagt), BIO2110 – Eksperimentell økologi (nedlagt).

Hjelpemidler til eksamen

Ingen hjelpemiddel tillatt. Kalkulator vil være tilgjengelig i Inspera under eksamen.

Eksamensspråk

Du kan besvare eksamen på norsk, svensk, dansk eller engelsk.

Karakterskala

Emnet bruker karakterskala fra A til F, der A er beste karakter og F er stryk. Les mer om karakterskalaen.

Adgang til ny eller utsatt eksamen

Studenter som dokumenterer gyldig fravær fra ordinær eksamen, kan ta utsatt eksamen i starten av neste semester.

Det tilbys ikke ny eksamen til studenter som har trukket seg under ordinær eksamen, eller som ikke har bestått.

Mer om eksamen ved UiO

• Kildebruk og referanser
• Tilrettelegging på eksamen
• Trekk fra eksamen
• Syk på eksamen / utsatt eksamen
• Begrunnelse og klage
• Ta eksamen på nytt
• Fusk/forsøk på fusk

Andre veiledninger og ressurser finner du på fellessiden om eksamen ved UiO.