MBV4140 – Anvendt bioinformatikk
Beskrivelse av emnet
Kort om emnet
Emnet gir en innføring i databaser som er av interesse for molekylærbiologer; DNA- og proteinsekvensanalyse ved bruk av DOTBLOT, FASTA, BLAST; DNA-sekvensediting og contigkonstruksjon ved bruk av STADENpakken; En introduksjon til grunnleggende UNIX-kommandoer vil bli gitt slik at programmer i EMBoss-pakken, BLASTALL og andre kan brukes på kommandolinjen .
Hva lærer du?
Emnet skal gi kunnskap og forståelse til Web-basert verktøy som er nyttig for molekylærbiologer. Dessuten vil du få inngående kjennskap til noen av de mest brukte verktøy. Du skal også bli vant til å bruke enkle UNIXkommandoer og vil få bra kjennskap til de grunnleggende prinsipper og potensiell bruk av EMBoss.
Opptak og adgangsregulering
Studenter må hvert semester søke og få plass på undervisningen og melde seg til eksamen i Studentweb.
Dersom du ikke allerede har studieplass ved UiO, kan du søke opptak til våre studieprogrammer, eller søke om å bli enkeltemnestudent.
Forkunnskaper
Anbefalte forkunnskaper
Du bør ha god kjennskap til molekylærbiologiske prinsipper.
Overlappende emner
- 10 studiepoeng overlapp mot BIO355
- 3 studiepoeng overlapp mot KJB492
Undervisning
Det er usikkert når emnet undervises neste gang.
Emnet strekker seg over seks uker med 24 t. forelesninger og 48 t. praktiske oppgaver på datamaskinen.
Eksamen
Prosjektoppgaver (50%) og skriftlig slutteksamen (50%). Bokstavkarakterer.
Emnet er valgfritt for studieretningene biokjemi og molekylærbiologi i masterprogrammet “Molekylærbiologi, biokjemi og fysiologi”