KJM9350 – Proteinkrystallografi

Kort om emnet

KJM9350 gir en grundig innføring i proteinkrystallografi, den sentrale teknikken for strukturbestemmelse av proteiner og biomolekylære komplekser. Teknikken vil bli undervist i teori og praksis, og vil gi et godt grunnlag for en PhD-oppgave innen fagområdet. Emnet skal også sette kursdeltagerne istand til å forstå og kunne vurdere moderne forskningslitteratur innen fagfeltet.

Hva lærer du?

Etter å ha fullført emnet:

• har du fundamental forståelse av proteinkrystallografi
• kjenner du til viktige fagbegreper og konsepter som symmetri, romgrupper, krystaller og krystallisering, diffraksjon, Braggs lov, faseproblemet, Fouriersyntese og Fourieranalyse, strukturløsning ved multiple isomorphous replacement (MIR), multiple anomalous dispersion (MAD) og molecular replacement (MR), Pattersonfunksjon, Pattersonkart og elektrontetthetskart, raffinering og validering
• har du praktiske ferdigheter i strukturbestemmelse av proteiner med røntgendiffraksjon
• får du innsikt i andre eksperimentelle metoder for 3D-strukturbestemmelse av makromolekyler som elektrondiffraksjon og kjernemagnetisk resonans (NMR) spektroskopi
• kan du utføre relevante databasesøk
• kan du lese, forstå og vurdere en krystallografisk artikkel

Opptak til emnet

Ph.d.-kandidater ved UiO søker plass på undervisningen og melder seg til eksamen i Studentweb.

Hvis emnet har begrenset kapasitet, vil ph.d.-kandidater som har emnet i sin utdanningsplan ved UiO bli prioritert. Noen nasjonale forskerskoler kan ha egne regler for rangering av søkere til emner med begrenset kapasitet.

Ph.d.-kandidater som har opptak ved andre utdanningsinstitusjoner må innen angitt frist søke om hospitantplass.

Anbefalte forkunnskaper

Det er en fordel å ha noe kunnskap om proteiner og grunnlegende matematiske kunnskaper.

Overlappende emner

• 10 studiepoeng overlapp med KJM4350 – Proteinkrystallografi.
• 10 studiepoeng overlapp med KJM3350 – Proteinkrystallografi (nedlagt).

Undervisning

Emnet går over et semester. Undervisningen består av:

• 27 timer forelesninger
• 30 timer obligatoriske regneøvelser og diskusjonskollokvier
• 8 timer obligatoriske laboratorieøvelser, og
• en obligatorisk litteraturoppgave som studentene må både presentere muntlig og levere inn skriftlig

For å kunne gå opp til eksamen, må du ha vært til stede på alle obligatoriske aktiviteter, og laboratoriekurset (inklusive maksimalt 2 siders rapport) og litteraturoppgaven må være godkjent.

I utgangspunktet skal alle obligatoriske oppgaver innleveres, men det er tillat å droppe én av følgende oppgaver: Patterson-øvelse, labrapport eller skriftlig innlevering av litteraturoppgave.

Et fullført og godkjent laboratoriekurs er gyldig i seks semestre utover det semesteret det ble godkjent. Etter denne perioden må du gjennomføre laboratoriekurset på nytt for å kunne fremstille deg til eksamen.

Det er obligatorisk oppmøte til første forelesning. Du mister plassen på emnet dersom gyldig forfall til første forelesning ikke er meldt til Kjemisk institutts før forelesningen starter.

Laboratorieundervisningen er obligatorisk og må være godkjent før du kan gå opp til eksamen. Fravær må dokumenteres med legeerklæring eller tilsvarende.

Eksamen

• Avsluttende muntlig eksamen som teller 100% ved sensurering.

For å gå opp til eksamen må du ha deltatt på alle obligatoriske aktiviteter, og laboratoriekurset og litteraturoppgaven må være godkjent.

Som eksamensforsøk i dette emnet teller også forsøk i følgende tilsvarende emner: KJM4350 – Proteinkrystallografi

Hjelpemidler til eksamen

Ingen hjelpemiddel er tillatt

Eksamensspråk

Du kan besvare eksamen på norsk, svensk, dansk eller engelsk.

Karakterskala

Emnet bruker karakterskala bestått/ikke bestått. Les mer om karakterskalaen.

Adgang til ny eller utsatt eksamen

Det arrangeres utsatt eksamen i starten av neste semester for studenter som dokumenterer gyldig fravær fra ordinær eksamen.

Det arrangeres ny eksamen for studenter som ikke består ordinær eksamen.

Studenter som trekker seg under eksamen blir ikke tilbudt ny eksamen.

Mer om eksamen ved UiO

• Kildebruk og referanser
• Tilrettelegging på eksamen
• Trekk fra eksamen
• Syk på eksamen / utsatt eksamen
• Begrunnelse og klage
• Ta eksamen på nytt
• Fusk/forsøk på fusk

Andre veiledninger og ressurser finner du på fellessiden om eksamen ved UiO.